مجلس إدارة الهيئة العامة لشئون التمويل العقاري هو السلطة العليا المهيمنه على شئونها والمسئولة عن  اقتراح السياسات العامة التى تسير عليها وله ان يتخذ ما يراه لازما من القرارات لتحقيق اغراضها ومباشرة اختصاصاتها وله على الاخص:

1. اصدار القرارات واللوائح الداخلية للهيئة والقرارات المتعلقة بشئونها المالية والفنية والادارية.
2. وضع لائحة لشئون العاملين بالهيئة تتضمن القواعد المتعلقة بتعيينهم وترقيتهم ونقلهم ومرتباتهم وبدلاتهم وحوافزهم ومكافاتهم وغير ذلك من شئونهم بمراعاة القواعد الاساسية والضوابط والضمانات المنصوص عليها فى نظام العاملين المدنيين بالدولة.
3. اتخاذ التدابير المنصوص عليها قى المادة (42) من قانون التمويل العقارى المشار اليه وذلك عند مخالفة احكامه او القرارات الصادرة تنفيذا له او قيام خطر يهدد استقرار نشاط التمويل العقارى او مصالح المستثمرين او المساهمين قى شركات التمويل العقارى.
4. الموافقة على مشروع الموازنة السنوي للهيئة.
5. النظر فى كل ما يرى الوزير المختص او رئيس الهيئة عرضه من المسائل الداخله فى اختصاصها.
6. النظر فى التقارير الدورية التى تقدم عن سير العمل بالهيئة ومركزها المالى.